英特尔、浪潮、华大基因、阿里云联合启动精准医疗GATK中国社区

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6月22日，在英特尔生命科学信息技术论坛上，英特尔、Inspur、华大基因和阿里巴巴云联合宣布成立gatk中国精密医学社区，并成为该社区的首批成员。Inspur人工智能与高性能计算公司总经理刘军在会议上做了题为“ai+hpc加速生命医学应用”的主题演讲。与此同时，英特尔还将最佳实践奖授予了Inspur Gene Integrated Machine，以表彰其对精密医学的贡献。英特尔公司副总裁、中国国家主席杨旭，中国科技部重大科学项目转录组研究首席科学家于君教授，美国远大研究院gatk团队代表凯特·沃斯等行业专家出席会议。

英特尔、Inspur、华大基因和阿里巴巴云联合推出了gatk中国精密医学社区

Gatk(基因组分析工具包)是最广泛使用的第二代重测序数据分析软件，由美国布罗德研究所开发。它主要侧重于发现突变和基因分型，并非常重视数据质量。gatk中国社区的推出不仅将极大地促进中国精密医疗用户更快、更好地应用gatk，也将成为英特尔精密医疗合作伙伴计划的重要组成部分。目前，英特尔正在尽一切努力推动该计划的发展，以期在2020年之前，在24小时内快速完成准确的医疗治疗，涵盖从基因测序到医疗分析以及最终制定医疗计划的整个过程。

精密医学依赖于高性能计算技术的发展

无论是治疗的有效性、减少医疗资源的浪费，还是更全面的健康管理，基于基因测序和大数据的精确医疗都将是未来人类医学发展的必然趋势，这也是政府和医学界的共识。

尽管未来发展潜力巨大，但精密医学的普及和发展并不总是一帆风顺，仍有许多痛点。除了由于隐私而难以收集健康数据之外，精确医学的发展还受到成本、医生素质、有针对性的药物开发和技术等问题的限制。其中，技术本身是精密医学面临的核心和根本问题。例如，在基因检测最成熟的nipt领域，面临着准确性、检测周期、假阴性和假阳性现象等诸多问题，这也是世界各国精密医学面临的共同问题。

在精密医学面临的众多技术问题中，高性能计算技术是一项关键技术。我们应该知道基因测序是精密医学的前沿技术，但目前基因组测序严重依赖于hpc，这直接关系到基因数据的测序精度和效率。例如，一个人的完整基因序列需要由几十万个基因片段拼接而成，而这些基因片段只能由hpc来完成。拼接结果的准确性和速度与高性能计算密切相关。此外，基因数据的比较、分析和诊断以及新药的研发都离不开hpc技术的支持。

Inspur基因计算集成机加速了精密医学的发展

在某种程度上，hpc技术决定了精密医学的质量和发展。基于hpc的Inspur基因计算集成机的推出，通过解决当前基因测序的效率问题，加速了精确医学的发展。

基因计算一体机是Inspur开发的生物信息学平台。它集成了基本的生物信息学工具，如bowtie、bwa和其他第二代测序比较工具以及fastqc和其他数据预处理工具。它可以分析第二代测序的数据，如全基因组重测序，大大减少了部署和优化时间，同时通过类傻瓜操作降低了使用阈值。

Inspiron Gene一体化解决方案荣获英特尔生物技术最佳实践奖

目前，Inspur基因计算一体机已在许多基因研究机构、大学和医疗机构得到应用，这种创新的基于平台的设备已在上海儿童医院开展的多项儿童罕见疾病研究中得到应用。上海儿童医院的医学专家借助Inspur基因机器预设的外显子组重测序和全基因组重测序流程，结合高通量测序和英特尔基因组数据库，可以更好地完成罕见疾病致病基因的还原和分析，并找到潜在的治疗方案。该系统现在可以在一天内完成多组样本的基因测序和检测过程，而在使用前需要几天才能完成同样的工作。

Ai+hpc将给医学领域带来颠覆性的变革

事实上，这一潮流并不仅仅局限于推动高性能计算的医学进步。随着人工智能技术的发展，Inspur开始探索人工智能在医学中的应用。刘军认为，如果hpc给医学带来了跨越式的发展，那么ai+hpc向医学领域的转变将是颠覆性的，这将在生产力方面给传统医学产业带来变化。

Inspur人工智能和高性能计算总经理刘军

人工智能在医学领域的应用包括手术机器人(300024，诊断单元)、医学影像诊断到远程医疗等。它主要用于医学诊断、辅助治疗和健康管理以及药物研发，其中医学影像是目前人工智能与医学结合最好的领域之一。80%以上的医学数据来自医学影像数据，这些数据高度标准化非常重要，便于机器阅读和学习。医学图像智能分析是建立一个深层的神经网络医学模型，然后将标记的数据训练到模型中，误差后调整模型参数，然后辅助医学知识。经过大量训练，形成准确的医学辅助诊断模型，从而完成医学图像的判读，识别准确率高，大大降低了医学误诊率，大大提高了医疗效率。

目前，Inspur已经开始设计人工智能业务流程，以帮助用户选择深度学习模型，并测试和验证识别的准确性。同时，优化的人工智能训练和推理性能也可以解决数据处理和训练中的瓶颈问题。

毫无疑问，使用人工智能作为辅助诊断工具将大大提高诊断的效率和准确性，这将带来更广泛意义上的精确医学。作为中国人工智能计算能力的领导者，Inspur在互联网行业积累了丰富的人工智能应用经验和基础，这将加速其在医疗行业的发展。目前，Inspur占据了中国ai服务器市场的60%以上，其中bat占据了80%，并已广泛应用于智能语音和智能图像领域，如iFlytek (002230)和face++等。